Lo spagnolo della Honda comanda entrambe le sessioni di libere del Gp di Malesia davanti al connazionale Marc Marquez. Nella sessione pomeridiana, Pedrosa si migliora ancora: 2’00″554, quasi sette decimi in meno rispetto al mattino. Staccati tutti gli avversari, a partire da Marquez che accusa oltre mezzo secondo di ritardo. Terzo tempo per Cal Crutchlow, a seguire Rossi, quarto ma a 984 millesimi. Il Dottore riesce però a far meglio di Lorenzo, sesto a 1″156. Ritardi di poco inferiori ai due secondi per Hayden e Dovizioso.
